بلافاصله امیر به عنوان تنها مظنون پرونده دستگیر و برای بازجویی به اداره آگاهی منتقل شد.وی در نخستین بازجویی‌ها به کارآگاهان گفت: 8 روز پیش درحالی که برای خوردن توت و بازی همراه هادی کوچولو به گندمزار رفته بود با پرتاب یک قطعه سنگ، هادی کوچولو را زخمی و بیهوش کرده است و بعد هم از آنجا گریخته است. کارآگاهان بلافاصله پس از شنیدن اظهارات امیر که به نظر می‌رسید در کلام و گفتار مشکل مادرزادی دارد به مزرعه موردنظر رفتند.
در ادامه نیز استخوان‌های پسر کوچولو را کشف کردند.تیم تشخیص هویت و پزشکی قانونی نیز پس از بررسی‌های لازم اعلام کردند استخوان‌ها متعلق به هادی کوچولو است.بدین‌ترتیب امیر، به اتهام آدم‌ربایی و قتل پسر 7 ساله تحت بازجویی‌های تخصصی قرار گرفت.وی در تمام مراحل بازجویی گفت: تنها با پرتاب سنگ باعث بیهوش شدن هادی کوچولو شده اما اتهام قتل پسرک را رد کرد.این درحالی بود که تمام شواهد علیه وی بود.
با وجود این امیر صبح دیروز در شعبه دوم دادگاه کیفری یک استان تهران بار دیگر محاکمه شد.سپس تحقیقات قاضی مقدم زهرا و اسلامی برای روشن شدن زوایای پنهان پرونده قتل هادی کوچولو آغاز شد.
قاضی مقدم زهرا پس از خواندن کیفرخواست، از متهم پرسید:
«آیا اتهام خود را مبنی بر آدم‌ربایی و قتل قبول داری» که وی در پاسخ گفت:
– خیر.
قاضی اسلامی: چند سال داری؟
– 24 سال
روز حادثه چرا هادی را با پرتاب سنگ زخمی کردی؟
– او به من ناسزا گفت و دوچرخه‌ام را می‌کشید که من هم او را دنبال کرده و با پرتاب یک سنگ زخمی‌اش کردم.
چرا هادی را به گندم زار بردی؟
– من با هادی دوست بودم، او را با دوچرخه‌ام سوار کرده و با هم رفتیم گندم زار که از درخت‌ها توت بکنیم و بخوریم.
چند ضربه با سنگ به سر هادی زدی؟
– یک ضربه.
آیا با ضربه‌ای که به هادی زدی او مرد؟
– نه، او نفس می‌کشید.
چرا پس از زدن ضربه کمکش نکردی یا به کسی خبر ندادی و نگفتی که چه اتفاقی افتاده؟
– ترسیده بودم و فکر نمی‌کردم بمیرد.
چرا پس از زدن ضربه و فرار دوباره برنگشتی ببینی چه اتفاقی افتاده؟!
– رفتم.
کی و چه وقت؟
– 4 روز بعد.
آن موقع هادی در چه حالی بود؟
-جسدش را دیدم که باد کرده بود.
چرا هادی را کشتی؟
– من او را نکشتم، فقط به او سنگ پرتاب کردم.
آیا به هادی تعرض هم کردی؟
– نه.
در ادامه بررسی این پرونده قاضی «مقدم زهرا» رئیس شعبه دوم دادگاه کیفری یک استان از متهم خواست آخرین دفاع خود را مطرح کند.
امیر نیز گفت: من هادی را نکشتم!
وکیل متهم نیز در دفاع از امیر گفت: کشف استخوان‌ها حاکی از این است که پس از اصابت سنگ به سر هادی، جنایت دیگری نیز رخ داده که باعث شده جسد هادی کوچولو در مدت 8 روز به تکه‌های استخوان تبدیل شده است. چون براساس نظریه پزشکی قانونی حداقل 40 روز زمان لازم است که جسد انسان به استخوان تبدیل شود.
گفتنی است تنها حلقه مفقوده این پرونده کشف این ابهام است که جسد پسرک چگونه در مدت 8 روز به چند تکه استخوان تبدیل شده است.
این در حالی است که هیچ اثری از آثار سوختگی یا اسید در بقایای جسد بر جا نمانده و پزشکی قانونی نیز در آزمایش‌های تخصصی استفاده از اسید را رد کرده بود.
همزمان با آخرین دفاعیات متهم، اولیای دم هادی نیز خواستار اشد مجازات برای عامل قتل شدند. قضات شعبه دوم دادگاه کیفری نیز پس از ختم جلسه، برای صدور رأی وارد شور شدند.